ACTA is een samenwerkingsverband van de Universiteit van Amsterdam (UvA) en de Vrije Universiteit Amsterdam (VU Amsterdam) en valt direct onder beide Colleges van Bestuur (CvB).
De leden van het bestuur (CvB) van beide universiteiten houden toezicht op het functioneren van ACTA:
De decaan van ACTA is volgens de Wet op het Hoger onderwijs en Wetenschap belast met de algemene leiding van ACTA en wordt daarbij ondersteund door het bestuur.